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PubMed利用法 Advanced Searchによる絞り込み検索
PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/ は米国国立医学図書館(National Library of Medicine:NLM)の国立バイオテクノロジーインインフォメーションセンター(NCBI)が1997年6月から運営しているMEDLINEを含む科学情報の検索サイトである。個人的な目的のための使用は無料である。すでにPubMedでのMedline検索法について紹介したが、ここでは、PubMedにあるAdvanced Searchを用いた上手な利用の仕方を紹介したいと思う。
Advanced Searchとは
下に示すのがPubMedのメインページであるが、左のメニューの中にAdvanced Searchというリンクがある。Advanced Searchの特徴は一つずつ語句の検索を行いながら、順次検索対象を絞り込んで行けるという点である。従って、インターネットへの接続時間をあまり気にしなくて済む環境にある人にとっては便利に使えるかもしれない。まずはここをクリックしてAdvanced Searchのページを開いてみよう。
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下にAdvanced Searchのページを示す。検索語を入力するフィールド以外にSearch Fieldというポップアップメニューと、Modeというポップアップメニューがある。
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右の三角をクリックすると次のようなメニューが現れる。すなわち以前紹介した検索モードでは[ ]カッコに書き込んで指定したタグをメニューから選択することが出来るようになっている。つまり、著者名で検索したければAuthor Nameを選択するし、雑誌名で検索したければJournal Nameを選択すればよい。その他、言語(Language)、出版の時期(Publication Date)、などを指定することが出来る。一方Modeの方は検索語をどのように指定したらよいかよく分からないときにList Termsを指定して検索すると関連した語句をリスト表示してくれるので、そこから選択して検索をかけることが出来る。通常はAutomaticのままで検索すればよい。
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さて、Advanced Searchがどのようなものかを理解するために、Gastroenterologyという雑誌の1998年12月号の内容を全部出してみよう。PubMedの通常の検索画面を使用する場合にはgastroenterology[ta] 1998/12[dp]で検索をすれば同じことになるが、Advanced Searchの場合には2段階でこれを行うことになる。まずSearch FieldでJournal Nameを選択して、検索フィールドにgastroenterologyと入力してSearchボタンをクリックする。
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すると、14396個のドキュメントがヒットした。下の画面がそうである。Add Term(s) to Query :と書いてあるように今度は最初にヒットしたドキュメントから更に絞り込みをかけるのである。また、Modify Current Queryと書いてある部分には検索に使われた語句の組み合わせが表示されるようになっており、検索を繰り返すたびに検索語が追加されて行くことになる。
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さて、Gastroenterologyという雑誌から1998年12月に発行されたものだけを拾い出すためには、Search FieldからPublication Dateを選択し、Enter Terms: に1998/12と入力する。(週刊の雑誌の場合には例えば、1998/12/10:1998/12/24というように一定期間を指定すればよい。)そして、Searchボタンをクリックする。
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こんどは47個のドキュメントがヒットした。Retrieve 47 Documentsと書いてあるボタンを見ればよい。Number of documents to display per page: の右に20となっているので、このままRetrieveボタンをクリックしても一つのページに20個しか表示されないので、不便だし、特にダウンロードしたい場合には一度で済ませたいので、ここを書き換えてこの場合には50にする。もっと多い場合にはそれに合わせて変える。そしてRetrieveボタンをクリックする。
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すると著者名、タイトル、雑誌名、年度、巻、ページなどがリスト表示される。あとはDisplayのフォーマットを選択して、DisplayボタンをクリックすればAbstract付きで一覧表示される。画面で見る場合にはデフォルトのAbstract Reportのままでよいし、あとでEndNote PlusなどでとりこむのであればMEDLINE Reportを選択する。右の小さな三角をクリックして選択する。
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もし、さらに絞り込みたければブラウザーの戻るボタンを使って前の画面にもどる。Advanced Searchを使う場合にはこのブラウザーの戻るボタンをうまく使わなければならない。つまり、Add Termsで検索語を追加して絞り込みをかけていくと、それが残っているのでやり直したい場合には必要に応じて何回も戻る必要が出てくるのである。そして戻った際にいまどの語句の組み合わせの検索画面かに注意しなければならない。
この例の場合に、もしGastroenterologyの1998年12月号に出ているulcerative colitisに関する文献だけを引き出したいのであれば、ここで前の画面に戻って、Enter Terms:のフィールドにulcerative colitisと入力してSearchボタンをクリックすればよい。すると、前の検索語句の組み合わせが残っていてそこにさらにulcerative colitisが追加されて検索が行われることになる。すなわち、gastroenterology[ta] AND 1998/12[dp] AND ulcerative colitisで検索するのと同じことになる。
ここでお気づきと思うが、Gastroenterologyのホームページを開いて目次を見るのと同じことがPubMedを使って出来るのである。ただし、最新号を見るには直接それぞれの雑誌のホームページを見た方が早いが、雑誌名をgastroenterology OR hepatology Or journal of hepatologyといったように複数組み合わせて検索すれば一度に複数の雑誌のある時期に出版された論文を引き出すことが出来る。
以上絞り込み検索に便利なAdvanced Searchの使い方について紹介した。
************1999.1.12 森實敏夫 morizane@kdcnet.ac.jp*************
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